Acoplamiento molecular por simulación computacional de compuestos naturales en territorio peruano como inhibidores de la enzima triptófano 2,3 dioxigenasa implicada en el metabolismo del triptófano en el glioblastoma

Abstract

El glioblastoma multiforme (GBM) es el tumor maligno más frecuente y agresivo del sistema nervioso central, caracterizado por una elevada resistencia terapéutica y una supervivencia media inferior a dos años. Entre los mecanismos moleculares implicados en su progresión destaca la activación de la vía inmunometabólica del triptófano, mediada por la enzima triptófano 2,3-dioxigenasa (TDO), la cual promueve la producción de metabolitos inmunosupresores como la quinurenina. El objetivo de este estudio fue identificar metabolitos naturales de plantas presentes en el territorio peruano con potencial inhibidor de TDO mediante acoplamiento molecular in silico. Se evaluaron 316 compuestos naturales obtenidos de bases de datos públicas, los cuales fueron sometidos a simulaciones de acoplamiento molecular utilizando AutoDock Vina. La afinidad de unión fue estimada mediante la energía libre de Gibbs y la constante de disociación, y las interacciones proteína–ligando fueron analizadas con PLIP y visualizadas con VMD. Los resultados permitieron seleccionar diez compuestos con mayor afinidad hacia TDO, destacando los dímeros de curcumina derivados de Curcuma longa. En particular, el curcumin dimer 3 mostró la mayor afinidad (ΔG = −9,7 kcal/mol), estableciendo interacciones hidrofóbicas, puentes de hidrógeno e interacciones π-stacking con residuos clave del sitio activo. En conclusión, los dímeros de curcumina emergen como candidatos prometedores para la inhibición de TDO en GBM. Estos hallazgos aportan evidencia novedosa y sientan las bases para futuras evaluaciones experimentales in vitro e in vivo orientadas al desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas.